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成都百菲特科技有限公司
CHENGDU BIOFIT BIOTECHNOLOGIES CO.,LTD
产品特点
无需RNase消化，特异性捕获DNA
适用范围广，有效去除多糖多酚，优秀的纯度和产量
产品编号
| 产品名称
| 规格
| 价格
|
DN32-50
| 植物基因组DNA提取试剂盒
| 50次
| 390
|
DN32-100
| 植物基因组DNA提取试剂盒
| 100次
| 690
|
产品简介
本试剂盒适用于从多种植物组织中提取基因组DNA，针对大多数植物样本可以实现特异性捕获DNA，无需单独的RNase消化步骤，操作流程简便快捷，特别适合富含多糖多酚、高淀粉含量、高蛋白含量、高油脂含量、水果、浆果、种子、花粉等类型的样本。
产品特点
无需RNase消化，特异性捕获DNA
适用范围广，有效去除多糖多酚，优秀的纯度和产量
适用样本类型
适用于小麦、水稻、玉米、红薯、紫薯、马铃薯、石斛、菠萝叶、油菜籽、麻风树、小麦种子、花生种子、水稻花粉、藻类等植物样本的DNA提取。
一、提取示例：
使用本产品提取小麦基因组DNA，电泳结果如下（图1.），DNA使用Thermo Nanodrop One测定浓度及纯度。
图1.小麦叶片基因组DNA电泳图(电泳上样0.5ul)
使用本产品提取小麦基因组DNA，电泳结果如下（图1.），DNA使用Thermo Nanodrop One测定浓度及纯度。
图1.小麦叶片基因组DNA电泳图(电泳上样0.5ul)
ID |
体积(uL) |
核酸(ng/uL) |
A260/A280 |
A260/A230 |
1 |
60 |
636.74 |
1.86 |
2.23 |
2 |
60 |
514.04 |
1.85 |
2.22 |
3 |
60 |
601.42 |
1.85 |
2.24 |
4 |
60 |
542.57 |
1.85 |
2.21 |
5 |
60 |
493.80 |
1.84 |
2.22 |
6 |
60 |
470.38 |
1.84 |
2.22 |
7 |
60 |
432.27 |
1.83 |
2.21 |
8 |
60 |
665.11 |
1.85 |
2.27 |
9 |
60 |
623.15 |
1.88 |
2.29 |
10 |
60 |
540.42 |
1.84 |
2.23 |
11 |
60 |
461.62 |
1.83 |
2.21 |
12 |
60 |
571.64 |
1.84 |
2.23 |
13 |
60 |
559.52 |
1.84 |
2.27 |
14 |
60 |
527.43 |
1.84 |
2.26 |
15 |
60 |
525.20 |
1.84 |
2.25 |
16 |
60 |
674.24 |
1.83 |
2.31 |
表1.小麦基因组DNA吸光度检测结果
结论：
1.吸光度检测结果可以看出各样本的纯度比值符合要求，DNA产量介于26-40ug之间，样本间DNA产量差异与样本用量有关；
2.电泳图显示无RNA残留，DNA条带亮度与OD测定的浓度值基本一致，间接说明DNA纯度正常，无其它吸光杂质；
3.本实验提取的DNA已用于二代测序建库，后续实验结果正常。
二、客户案例：（本产品与常规CTAB法对比测试）
客户使用传统CTAB法提取的小麦叶片DNA，编号为S、R；样本C为本方法提取的小麦叶片DNA，此处作为对照。
图2.传统CTAB法与DN32提取的小麦基因组DNA
表2.传统CTAB法与DN32提取的小麦DNA吸光度检测及Qubit检测结果
问题分析：
1.样本S和R，OD检测的浓度达到1000ng/ul(虚高)，但电泳时DNA条带的亮度确非常低，经Qubit检测后，实际DNA浓度只有55ng/ul左右，说明提取的DNA中含有在260nm有高吸光的杂质；
2.结合A260/A280约为2.0，说明样本S和R中可能含有RNA，从电泳图的红色方框中可以看出疑似RNase消化后残留的小片段RNA。
讨论：
对于本案例中使用传统CTAB法提取的小麦DNA，如果在电泳时不加入样本C作为对照，也不使用Qubit测定DNA浓度，通常很难发现DNA浓度存在虚高的问题。这样的DNA虽然可以用于PCR一类的实验，但对于NGS建库来说，会因为Input DNA严重不足导致建库异常甚至失败，会给实验分析带来不必要的麻烦。
结论：
1.吸光度检测结果可以看出各样本的纯度比值符合要求，DNA产量介于26-40ug之间，样本间DNA产量差异与样本用量有关；
2.电泳图显示无RNA残留，DNA条带亮度与OD测定的浓度值基本一致，间接说明DNA纯度正常，无其它吸光杂质；
3.本实验提取的DNA已用于二代测序建库，后续实验结果正常。
二、客户案例：（本产品与常规CTAB法对比测试）
客户使用传统CTAB法提取的小麦叶片DNA，编号为S、R；样本C为本方法提取的小麦叶片DNA，此处作为对照。
图2.传统CTAB法与DN32提取的小麦基因组DNA
ID |
核酸(ng/uL) |
A260/A280 |
A260/A230 |
Qubit定量[ng/ul] |
方法 |
S |
1079.87 |
2.00 |
2.40 |
55 |
CTAB |
R |
1016.03 |
2.01 |
2.46 |
56 |
CTAB |
C |
160.64 |
1.83 |
2.39 |
158 |
DN32 |
问题分析：
1.样本S和R，OD检测的浓度达到1000ng/ul(虚高)，但电泳时DNA条带的亮度确非常低，经Qubit检测后，实际DNA浓度只有55ng/ul左右，说明提取的DNA中含有在260nm有高吸光的杂质；
2.结合A260/A280约为2.0，说明样本S和R中可能含有RNA，从电泳图的红色方框中可以看出疑似RNase消化后残留的小片段RNA。
讨论：
对于本案例中使用传统CTAB法提取的小麦DNA，如果在电泳时不加入样本C作为对照，也不使用Qubit测定DNA浓度，通常很难发现DNA浓度存在虚高的问题。这样的DNA虽然可以用于PCR一类的实验，但对于NGS建库来说，会因为Input DNA严重不足导致建库异常甚至失败，会给实验分析带来不必要的麻烦。
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无
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